天后宮位於今台南市安南區媽祖宮顯草街三段1巷236號。是台江內海的首要軍事，於北線（汕）尾島與隙子島之間的港汛，鄭成功打敗荷蘭，有中外史家所稱頌的台灣之門、全台門戶....等等美譽。

鹿耳門北汕尾島，自古來的聚落就只有島嶼北邊的媽祖宮村（顯宮里與鹿耳里），顯宮與鹿耳兩里居民，以鹿耳門天后宮為宗教、文化、政治、社教活動中心；與全國各地一千餘尊媽祖神明結為「媽祖金蘭姊妹會」。

建築依照古制，巍峨壯觀，莊嚴肅穆。廟內供奉的『鹿耳門媽』，面容慈祥莊嚴，刻工精美，以大陸稀有的千年萱芝木材－－紫檀木所雕刻成。